La Sociedad Deportiva Logroñés se fundó el 18 de enero de 2009, después de la segunda incomparecencia y exclusión del Club Deportivo Logroñés de la Liga debido a problemas financieros. La afición se unió y un grupo de socios del CD Logroñés se reunió para debatir sobre la situación y fundar un nuevo club que reflejara su pasión por el fútbol.
Una plataforma llamada «Puerta Cero» coordinó los esfuerzos para crear el nuevo club y logró reunir 500 firmas de apoyo en abril de 2009. Se llevaron a cabo reuniones con administraciones políticas, empresarios y la formación de un equipo técnico y una plantilla.
La primera asamblea de socios se llevó a cabo el 4 de junio de 2009, donde se eligió el nombre, los colores y el escudo del nuevo club: Sociedad Deportiva Logroñés. Rafael Álvarez se convirtió en el primer presidente.
La SD Logroñés contrató a su primer entrenador, Alejandro Fernández, y comenzó a formar su plantilla. El primer partido fue un amistoso contra el CD Arnedo, que ganaron 0-4. Luego, se presentaron oficialmente ante el Deportivo Alavés.
La temporada 2009/2010 fue histórica en Regional Preferente, ya que ganaron 39 de 40 partidos, logrando el ascenso a Tercera División.
En 2010, el club se vio obligado a cambiar de campo debido a problemas financieros con el estadio Las Gaunas y comenzó a jugar en el Mundial 82 de Logroño.
En la temporada 2012/2013, la SD Logroñés debutó en Segunda División B y tuvo un rendimiento meritorio.
La temporada 2014/2015 estuvo marcada por la creación de un equipo femenino y un intento fallido de ascenso a Segunda División B.
En la temporada 2015/2016, el equipo logró la Copa Federación en su fase autonómica y se mantuvo en la parte alta de la tabla en Tercera División.
En la temporada 2017/2018, nuevamente se luchó por el ascenso a Segunda División B, pero no se logró.
En la temporada 2019/2020, la SD Logroñés fue campeona en la liga regular, pero debido a la pandemia de COVID-19, se decidió un play-off express. Lograron el ascenso a Segunda División B al vencer en la final.
En la temporada 2020/2021, la SD Logroñés compitió en Segunda División B y tuvo un rendimiento destacado en su grupo, enfrentándose a los desafíos de la pandemia.
¡Esta es una historia de perseverancia y pasión por el fútbol que ha llevado a la SD Logroñés a alcanzar importantes logros en su corta historia!
